31/3/20

Los alfa-aminoácidos y el pH del medio

FICHA 4

Espero que les haya llamado la atención el hecho de que los ejemplos muestran la migración de un protón (catión H+) del grupo carboxilo al grupo amino en posición C-alfa. No se ve -COOH y -NH2 !!

Es una reacción ácido-base interna. Las aminas son las bases de la Química Orgánica, el par de electrones sobre el átomo de nitrógeno atrae al hidrógeno lábil del grupo carboxilo que migra, dejando por esa razón anión carboxilato (-COO-) y catión amonio (-NH3+). En la figura siguiente es la estructura central, llamada ZWITTERION o también IÓN DIPOLAR porque lleva una carga positiva sobre el N y una carga negativa sobre O, como se puede calcular la carga neta es nula q neta = 0 para esta especie.


¿Qué ocurre si se coloca unas gotas de ácido o de base ?

El medio muy ácido proveería de catión H+ externo, que será atraído por el carboxilato (-COO-) neutralizándolo y obteniéndose carboxilo (-COOH) en su lugar. La carga total ahora es q = +1 (fórmula de la izquierda) por lo que se llama ESPECIE CATIÓNICA del alfa-aminoácido.

El medio básico producirá el efecto contrario, quitando el protón (H+) que estaba sobre el átomo de nitrógeno. Por supuesto no tiene efecto sobre la carga negativa del oxígeno. Total que la carga neta de la fórmula de la derecha es q = -1 por eso se llama ESPECIE ANIÓNICA del alfa-aminoácido.

Estas reacciones constituyen EQUILIBRIOS QUÍMICOS, dependientes además de la temperatura de las soluciones. Como en toda situación de equilibrio, todas las especies involucradas están presentes aunque sea en un mínimo porcentaje. Quiere decir que variando el pH del medio es posible obtener mayor concentración de la especie catiónica o del zwitterion neutro o de la especie aniónica, pero NO podríamos decir que exclusivamente una de ellas.

Es muy interesante el experimento de electroforesis. Una solución del aminoácido preparada a determinado pH migra hace uno de los electrodos de un campo eléctrico. Si se prepara a otro pH puede migrar al otro electrodo o no migrar !



En esta figura se observan varias gotas de diferentes alfa-aminoácidos en un extrema de la placa de apoyo. Se observará su migración hacia el polo positivo. Las constantes de equilibrio ácido-base de las cambios estudiados son todas distintas según qué aminoácido sea. Por eso aunque el punto de partida sea el mismo, el movimiento en un campo eléctrico será diferenciado.

El PUNTO ISOELÉCTRICO es el pH de la solución del aminoácido en que no se produce migración hacia los electrodos de un campo eléctrico. A ese pH también se cumple -es la razón de lo anterior- que la especie mayoritaria presente es el zwitterion.

TAREA 8. Hay dos alfa-aminoácidos "ácidos" : ácido aspártico y ácido glutámico. Y tres alfa-aminoácidos "básicos" : lisina, arginina, histidina. Las cadenas laterales de todos ellos contienen un grupo funcional EXTRA. Observe que aspártico y glutámico tienen un nuevo carboxilo (-COOH) en sus cadenas laterales; los otros tres tienen grupo amino (-NH2) extra en ellas. Eso genera nuevos equilibrios ácido-base según el pH.

Su tarea es buscar el diseño completo de los equilibrios ácido-base a distintos pH (como lo hicimos antes) para la lisina y el ácido aspártico. Estableciendo sus especies catiónicas y aniónicas y hallando el zwitterion. Busque los datos numéricos de pH de los dos zwitteriones.




¿Cómo funciona un POLARÍMETRO?

FICHA 3

Interior de un Polarímetro

CÓMO SE UTILIZA

QUÉ SE VE POR EL VISOR

El tubo interior o tubo de la muestra contiene una sustancia pura o bien una solución de la sustancia en estudio. La densidad de la sustancia o la concentración de la solución, así como su temperatura, deben ser conocidas/controladas porque mostrarían variaciones en los resultados. Asimismo si el largo del tubo (trayectoria o camino óptico que realizará la luz polarizada atravesando el tubo de muestra) no fuese de 2 dm como es habitual. También depende de la longitud de onda de la luz utilizada.

El ángulo de rotación alfa de la luz polarizada se indica en grados. Está estandarizado para la longitud de onda de la línea D amarilla de lámpara de sodio que es 589 nm, temperatura de 20ºC, contenido del tubo concentración de un g/mL.

La rotación específica es una constante física de una sustancia ópticamente activa. Si fuese otra la situación, habría que hacer las respectivas correcciones.





Isomería óptica de alfa-aminoácidos

FICHA 2

El C-alfa de los alfa-aminoácidos es un C-quiral, está unido a 4 sustituyentes diferentes.
Como consecuencia, existe su imagen especular (imagen en el espejo, simbolizada por la línea punteada) y se observa que no es "superponible". No superponible quiere decir que, aunque coincidan las esferas central/arriba/abajo no van a coincidir las esferas derecha/izquierda. Ésto sucede con sus dos manos, en el espejo se enfrentan, al poner una sobre otra se ve que son opuestas.

COMPUESTOS CUYAS ESTRUCTURAS SON IMÁGENES ESPECULARES NO SUPERPONIBLES SE LLAMAN ENANTIÓMEROS.  Delante de su nombre debe indicarse (+) o (-) según sea el enantiómero correspondiente.


¿ Por qué importa este detalle de la estructura?
Porque:

1) existe una propiedad llamada ACTIVIDAD ÓPTICA que se mide en un POLARÍMETRO y que tiene como resultado igual valor numérico pero de signo opuesto entre dos enantiómeros. 
¿Hay una relación entre la forma de dibujar la molécula y el signo que va a tener la propiedad? NO.
Por un lado se han realizado mediciones de la propiedad y por otro (sin relación uno con otro) se buscó la forma de simbolizar la manera cómo están conectados los átomos en la fórmula. 
Para formular se utilizan FÓRMULAS DE FISCHER : la cadena carbonada en vertical con el C-1 arriba (en el dibujo representados por naranja, gris, amarillo donde el C-1 es naranja) y los sustituyentes que quedan tienen un orden de prioridad entre ellos (por ej. metilo comparado con hidrógeno sería rojo >verde).  Si el sustituyente prioritario está a la izquierda en la fórmula de Fischer de la molécula, es L. Si está a la derecha es D.

2) porque a nivel biológico dos enantiómeros manifiestan distintas propiedades. Por ej. (+) leucina es dulce y (-) leucina es levemente amarga. Existen numerosos ejemplos de pares de enantiómeros en que uno es útil y el otro tóxico. 


Todos los alfa-aminoácidos presentan actividad óptica MENOS la glicina (no tiene 4 sustituyentes diferentes en el C-alfa, por tanto no es quiral). Y todos estos alfa-aminoácidos formadores de proteínas son L. Como siempre: existen otros casos, pero no son "proteinógenos".

TAREA 7. Además de la actividad óptica, ¿qué otras propiedades físicas y químicas tienen los alfa-aminoácidos?

¿Qué es un alfa-aminoácido ?

FICHA 1

Es un compuesto que posee ambos grupos funcionales : amina (-NH2) y carboxilo (-COOH). En particular, los alfa-aminoácidos dan origen a proteínas;siendo el C-1 el mismo grupo carboxilo (-COOH) decimos que su C-vecino es C-alfa y allí debe encontrarse el grupo amino (-NH2). Observe que todos los alfa-aminoácidos presentan la misma estructura en extremo de cadena pero difieren en las cadenas laterales, que llamamos genericamente "cadenas -R"
Existen muchos aminoácidos que no son alfa-aminoácidos pero no los estudiaremos porque no formarán parte de proteínas...
TAREA 5. Infórmese sobre la fórmula y la importancia del neurotransmisor GABA. Conserve ese ejemplo de una aminoácido que NO es alfa.

Como la única diferencia entre los alfa-aminoácidos formadores de proteínas son sus cadenas laterales, es de suma importancia observar y clasificar esas cadenas de acuerdo a sus propiedades. Ellas influyen en el contacto del aminoácido con su entorno !

Hay cadenas laterales no cargadas pero polares porque en las cadenas laterales poseen nuevos grupos funcionales que le dan esa característica, por ej.: es el caso de serina y treonina.
Hay cadenas laterales cargadas electricamente a ciertos valores de pH (son positivas o son negativas) y se clasifican como aminoácidos ácidos o aminoácidos básicos, por ej. es el caso del ácido aspártico o de la lisina y otros. Hay cadenas laterales hidrofóbicas como en la leucina, o aromáticas como en el triptofano, etc.

 TAREA 6. Vea la siguiente figura para citar todos los ejemplos de todas esas categorías distintas de alfa-aminoácidos, escribiendo el nombre del alfa-aminoácido con el sistema de 3 letras y su fórmula.